上海烈冰信息科技有限公司 -- www.gootopsoft.cn

   上海烈冰信息科技有限公司(Novel Bioinformatics Company)是由上海交通大学的数位博士组建的生物信息服务公司。公司以“专业、创新、真诚”为理念，以强大的计算机、数学、生物学为技术依托，致力于开发数据库系统、生物芯片以及高通量测序等数据分析平台，就基因组学、转录组学、转录后调控及蛋白组学在数据层面进行分析。NBC(Novel Bioinformatics Company)自主研发的算法及相关软件已经发表了方法学文章，并且得到了国际的认可。
         NBC目前的平台能够为基因芯片用户提供模式鉴别、趋势、功能、信号转导通路、系统生物学网络等分析；为二代测序用户提供质量控制、mapping、reads分布、基因定位及注释、可变剪接等分析。NBC对较为前沿的De nove Sequencing、RNA-Seq，MeDIP-Seq，CNV,GWAS等数据分析技术投入了极大的研发力量，并积累了大量实际数据分析项目的经验。
         NBC在上海交通大学设立了联合实验室，在不断拓展和完善现有分析平台的同时，也与多家科研机构合作，联合开发具有国际一线水准的分析方法及软件。
         NBC在注重研发的同时，更加注重服务，我们愿与您深度的沟通，以真诚及专业的服务与您并肩向前。

基因芯片作为常见的高通量基因检测工具，有着广泛、大量的应用。Novel Bio芯片数据分析平台可以对cDNA芯片，microRNA芯片，甲基化芯片,蛋白组数据进行深度的数据挖掘。Novel Bio基因芯片平台的主要有基于优良算法的模式识别系统、基于信息全面的数据库注释系统、基于数据库平台的功能及Pathway显著性分析系统、基于数据库平台的基因间相互作用关系网络构建系统、基于芯片实测表达值的共表达网络构建系统、基于算法及数据库的microRNA靶基因预测系统、microRNA与靶基因调控网络构建系统、转录因子预测系统、分子标志物诊断系统构成，每个模块都进行了精心及科学的设计，并通过了大量实际分析项目的检测，同时数篇发表论文。公司提供专业且经验丰富的方案咨询指导，能够为用户提供数据分析方案及平台操作指南。基因芯片分析平台适合芯片量大，实验设计丰富的用户按照自身需求的分析模块进行搭建，对于芯片数据量小的用户可以选择数据分析服务，由Novel Bio全程将数据分析及分析结果报告完成，并提供长效的技术支持。

测序，而不是杂交，相对于基因芯片提供了更准的精度与更高的分辨率。Novel Bio的高通量数据分析平台支持Solexa/HiSeq2000, 454和SOLiD等测序数据，提供了从全基因组的De Novo Sequencing、Resequencing，到基因组的ChIP-Seq、MeDIP-Seq，以及转录组的DGE、RNA-Seq、microRNA-Seq...这一系列测序数据的全套分析方案。测序分析，不仅仅是mapping和annotation，无论是RNA-Seq的可变剪接，还是MeDIP两条链不同甲基化的比较，又或是ChIP-Seq Motif的查找......FricePlatForm对于测序数据的深入挖掘，帮助您进行全新的探索、发现和解决全新的生物学问题。测序获得的基因信息还可进行基于基因信息数据库的全方位挖掘。不仅仅是GO和Pathway，FriceBio整合了目前国际最新的算法与基因信息数据库，对于基因互作、PPI、co-expression等网络构建都有独到见解并由此解释生物学问题，并以此发表若干相关论文。Novel Bio还提供专业且经验丰富的方案咨询指导，能为您提供数据分析思路以及平台操作指导。

基因信息注释的全面性和准确性将直接影响数据分析的质量。Novel Bio为了追求高质量的分析结果，不仅仅是GO和KEGG Pathway，NBC的基因信息平台整合国际各种最新的生物数据库于一体，包括Biocarta、Reactome、miRBase、snpdb......。通过这些数据库的整合，NBC构建了一套完备的Annotation体系平台，其中囊括了pathway、基因互作、PPI、基因与文献、microRNA与疾病、SNP与疾病......。将实验获得的基因信息导入Novel Bio Annotation体系，轻点按钮，您就可以看到一系列的基因相关信息以网络的形式展现出来。为了方便用户使用，NBC还特意开发了非模式物种基因信息查询系统，并实现了高质量的模糊查询技术，同时还整合了ID Convert，方便您用各种基因名称或编号对基因信息进行查询。为保证数据库的有效性，Novel Bio每隔3个月就会进行一次全方位的数据库升级，尽力将最新的资源运用于生物信息的分析。

科研文献及各种生物医学数据库中蕴藏着丰富的生物医学知识，通过运用不同的文本挖掘/机器挖掘方法，可以有针对性的从中提取出研究者所关心的知识。Novel Bio从文献数据库中获取海量的文献数据，在验证数据的完整性的基础上提取出其中的特定重要信息。文本挖掘平台对提取的特定重要信息进行统计及自然语言处理(Nature Language Process, NLP)，从而挖掘出实体(可以是基因，蛋白，miRNA等)名称、实体之间的作用模式和实体互作网络等知识。文本挖掘平台包括以下几个模块：(1)文献收集模块，主要功能包括文献下载、文献相关度检验; (2)文献预处理模块，主要功能为从下载数据中提取出指定的信息，并保存为特定的格式; (3)自然语言处理模块，主要功能为分词、实体名称识别、词性标注、实体名称及动词的标准化处理和实体名称的数据库映射等; (4)作用关系挖掘模块，主要功能为计算实体Co-occurence的概率，并提取实体间的关系模式，并提取对应的关联实体; (5)网络构建模块，主要功能是构建具有统计学意义的相互作用网络,并提供图形化的分析结果。文本挖掘平台适合用户专业快速的解某一研究方向, 并挖掘出非常有实用价值的关键信息，同时该平台可应用在各种基金（国家自然科学基金，863，973等）的申请，课题结题等诸多领域。