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单细胞多组学数据分析可视化系统

集成单细胞分析结果可视化展示与交互式解读为一体的软件产品,无需依托任何服务机构,快速筛选单细胞分析结果的关键信息,自主绘制形式多样的结果图片,一站式串联研究论著文章故事线。

页签功能实现

(一)QualityControl

展示单细胞分析流程上游的数据质控和细胞判定环节的数据分析结果。

(二)CellBrowser

展示细胞降维聚类、细胞类群标识基因分析、细胞类群标识基因功能和通路分析、细胞类群在不同样本分组下的丰度变化以及细胞类群在各个样本细胞中占比的结果。

(三)Pseudotime

在线实时查看拟时序图中随着拟时序轨迹各细胞类群之间可能的演化关系,以及细胞类群或样本的概率密度分布曲线。通过点击拟时序图中分支节点,切换拟时序分支热图查看对应的基因模块,以及这些基因模块对应的功能通路分析结果。也可查看用户关注的基因在拟时序图中表达情况。

(四)CellPhone

用户可在线实时通过热图 (HeatMap)/弦图 (CircosPlot)查看各细胞类群作为配体受体之间潜在的交互作用。通过点击指定条目,可在气泡图 (BubblePlot)/网络图 (PairNetWork)中查看蛋白互作的详情,并在数据表中查阅到相关数据。

(五)QuSAGE

QuSAGE工具的主要内容是基因表达集合定量分析的可视化展示与交互式解读。

(六)SCENIC

SCENIC工具的主要内容是转录因子调控网络分析的可视化展示与交互式解读。

文章排图实例

以下图片全部由单细胞可视化系统软件绘制完成,并按照经典单细胞文章图片样式排版

图 1 : 膀胱癌的细胞图谱

图 2 :膀胱癌中内皮细胞图谱

图 3 :膀胱癌中内皮细胞的演化路径及细胞间通讯