听说原位空间组学技术很火？【Xenium 专题】

Chromium——解决了细胞异质性问题，但是缺乏空间信息

Visium——可以提供空间信息，但分辨率有限

Xenium in Situ——可读取空间信息、具有亚细胞分辨率，能判断细胞位置和功能

Xenium 原位分析概述

• 将新鲜冷冻（FF）和石蜡包埋（FFPE）组织中的数百种RNA进行表达分析并精确到亚细胞定位
• 将会对我们理解肿瘤微环境、免疫、神经科学、细胞特异性、生物发育等方面产生深远的影响，并进入空间单细胞/亚细胞研究的新时代

01 实验流程概览

02 平台特点

• 高样本兼容

可以兼容冰冻切片FF和石蜡FFPE组织，满足临床及科研样本的检测分析需求

• 一流的速度通量

超大的可成像区域（12 x 24 mm2），每次可同时加载和分析两张载玻片

• 多重分析和亚细胞分辨率

Xenium平台目前可检测多达400个RNA转录本

• 可定制的甄选基因组合

商业化panel + 可自由定制包含非模式物种gene list

• 应用领域广泛

从医学到非模式物种科学研究，全领域覆盖

• 无损性

处理后也可以进行H&E染色和IF染色，从而能够将转录数据与形态学数据直接进行比较

• 简单易用

无需NGS测序，交互式可视化软件

03 现有Panel

• Pre-designed panels: 人（乳腺、肺、脑、皮肤、肠、multi-tissue）；小鼠（脑、multi-tissue）【可定制增加100 genes，已经验证过的panel，可立即发货】
• Standalone panels: 哺乳动物、具有注释良好的转录组的其它物种【4-6周设计交付】

04 高效数据可视化

Xenium运行结束无需测序即获得可解读，能可视化的结果，同时也 兼容Seurat，Stlearn等第三方算法包 ，对于目的数据进行基于细胞和空间维度的分析与深层次解读，兼具易用性和深度。

05 可解决的科学问题

• 亚细胞空间分析

亚细胞分辨率可以解析细胞结构以及功能

• 生物标志物发现

发现其他技术可能忽略的细胞和疾病过程的新型生物标志物和基因特征

• 多组学联合

Xenium原位分析数据与单细胞数据进行直接比较，实现对肿瘤微环境中细胞类型的解析、不同基因表达的分析

• 空间解构新策略

同时解析数百种RNA表达，并可同时从同一张组织切片中获得蛋白质和组织学信息，解构组织中的细微结构，了解其与细胞和基因/蛋白表达的相互关联与作用

• 其它科学问题...

Xenium发文预览

Xenium原位技术在各个领域的应用都已经全面开展，并有多篇文章发表！

01 单细胞、空转和原位分析（Xenium）联合解析乳腺癌石蜡切片肿瘤微环境

02 高分辨率空间转录组学分析（Xenium）解码乳腺癌和从属微环境的空间组织解构及其成因

03 单细胞尺度级别的原位测序（Xenium）揭示了多发性硬化症病变和疾病演变的空间动态

04 原位空间组学揭示了卵巢癌的免疫逃逸在基因-细胞-组织水平上的驱动机制

烈冰生物引入10X Xenium 平台，结合烈冰生物 NovelBrain 百万级大通量生产级 数据分析系统，强强联合， 共同为研究者创造高效，高质量，高性价比，高可视化度，高便捷度的空间组学研究服务新生态。

烈冰优势

• 国内最早引入Xenium公司之一，烈冰率先完成APT测试实验，现已正式开展客户的实验，助力客户早日产出科研成果
• 烈冰是10x Genomics 官方指定的Xenium原位分析技术服务商
• 烈冰已助力发表多篇单转结合空转的高分文献，具备丰富的空间转录组学的分析经验

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