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烈冰生物自研微孔法单细胞捕获系统 NovelCyto(以下简称NC 1.0) 现已升级至 NovelCyto V2.0(以下简称NC 2.0)。通过对核心磁珠体系进行优化,实现了 Cell Barcode 识别率、有效细胞数、基因检出数和 UMI 检出数的全面提升,同时保持细胞类型组成基本一致,为单细胞转录组研究提供更高效、更稳定的技术支撑。

图1 NovelCyto V2.0 + 真迈SURFSeq
单细胞测序平台全新升级
NovelCyto V2.0 的核心升级来自磁珠结构与构建流程优化,将三段法升级为二段法,在优化工艺流程的同时,提高磁珠制备效率和批次稳定性,并减少了Cell Barcode拼接过程中的损耗和错误累积,提高完整Cell Barcode磁珠比例。

图2 磁珠体系升级:三段法优化为二段法
NovelCyto V2.0在单细胞捕获与 Cell Barcode 识别环节具有更高效率,能够在相同样本条件下获得更多可用于后续分析的有效细胞,为稀有细胞识别、亚群精细注释和组间比较提供更充分的数据基础,更高的 Cell Barcode 识别率直接转化为更高的有效细胞回收能力,使同一样本条件下可获得更多可分析细胞,提高珍贵样本的利用效率。

图3 NC 2.0 提升 Cell Barcode 识别率与有效细胞数
基因与 UMI 检出能力增强,保持细胞组成稳定,增强但是没有增大偏移
在PBMC样本中,NovelCyto V2.0在测序饱和度更低的情况下,获得更高的 Median Genes(34%提升)、Total Genes(6%提升)和 Median UMI Counts per Cell(60%提升),说明单细胞转录本信息获取更加充分,有助于提升后续细胞注释、差异分析和功能解析的可靠性。

图4 NC 2.0 显著提升基因与 UMI 检出能力
NC 1.0与NC 2.0在主要细胞类型比例上整体保持一致,包括 T cell、NK、B cell、Plasma cell、Monocyte、Platelet 等群体,未观察到明显的细胞类型偏倚,同时基因检出数提高是全面地在所有细胞类型中发生的。去掉低质量细胞后,NC 2.0相对于NC 1.0有效细胞数有25%左右的提升。

图5 细胞组成稳定,单细胞基因检出更高
烈冰生物,通过真迈SURFSeq系列高通量测序平台,支持多种读长策略和灵活数据产出方案,满足不同单细胞项目对数据量、测序周期和数据质量的需求,能保证测序数据质量稳定,Q30/Q40 均可达到高品质交付标准,为单细胞转录组项目从样本处理、细胞捕获、文库构建到测序交付提供一体化解决方案。

图6 真迈SURFSeq系列高通量测序平台
NovelCyto V2.0 +真迈SURFSeq服务全面升级为用户带来更高效的捕获,更深入的解析,更稳定的交付,带来单细胞数据质量的系统提升。
温馨提示:由于NC 1.0与NC 2.0在Cell Barcode结构层面存在差异,建议同一项目单细胞试剂盒版本保持一致。
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