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什么是ATAC-seq?
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing)利用高活性的Tn5转座酶,能够特异性插入染色质开放区域,同时完成DNA片段化和接头添加,从而绘制全基因组的染色质可及性图谱。它告诉科学家:细胞的“调控开关”在哪里开放。
近日,斯坦福大学医学院团队在《Science》发表了一项重磅研究:Mucosal vaccination in mice provides protection from diverse respiratory threats(小鼠黏膜疫苗为多种呼吸道威胁提供广泛保护)。
这项研究揭示了一种全新的疫苗策略——不模拟病原体本身,而是模拟免疫系统在感染时的“沟通信号”。研究团队开发的鼻喷黏膜疫苗,在小鼠模型中可对SARS-CoV-2、其他冠状病毒、金黄色葡萄球菌、鲍曼不动杆菌,甚至尘螨过敏原提供持续数月的广谱保护。
为什么这项研究能登上Science?
因为它在免疫学层面回答了疫苗研发的终极问题:如何同时激活先天免疫和适应性免疫,在肺部建立一个持续数月的免疫“预警状态”?
研究发现,疫苗诱导的持久保护依赖于:
1、CD4和CD8记忆T细胞的长期存留
2、肺泡巨噬细胞的功能重塑(增强抗原提呈和抗病毒能力)
3、感染后快速启动病原特异性T细胞和抗体反应
为何这项研究离不开BD单细胞ATAC?
在这项Science研究中,研究者共分析了:
值得注意的是:scATAC-seq数据中成功捕获并分析了中性粒细胞(Neutrophils),其在传统微流控平台中极易因剪切力而破碎丢失,而BD微孔板重力沉降技术,让这类关键免疫细胞的表观分析成为可能。
这些免疫机制的深度解析,离不开对T细胞克隆演化、巨噬细胞表观重编程的单细胞尺度研究,尤其当研究对象涉及脆弱细胞、需要表观与转录联合分析、或需要在组织空间维度解析免疫网络时。而这,正是BD单细胞ATAC-Seq技术的核心应用领域。

作为BD Rhapsody平台的深度合作伙伴,烈冰生物现已全面引进BD ATAC-Seq方案,成为国内首批具备该技术服务能力的平台之一。无论您是研究脆弱细胞、珍贵样本,还是希望在同一实验中同时获得染色质开放性和基因表达信息,我们都能为您提供完整解决方案!
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