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生信分析平台 实验进度查询

2010

破茧新生

在基因测序的浪潮初起之年,几位怀揣梦想的有志青年在上海创立了烈冰生物。 彼时,他们或许未曾想到,这家从零起步的企业,会在未来十年改写中国单细胞技术的版图。

2012-2014

双翼初展

当行业还困于"重硬件、轻分析"的惯性时,烈冰却另辟蹊径——以"测序+分析"双引擎驱动科研革命。 2014年,烈冰生物信息云平台NovelBrain横空出世,如同一座架在数据洪流上的"云端实验室",让研究者无需代码基础即可完成复杂分析。 这一剑,劈开了生物信息学的技术垄断,也让烈冰的名字与"颠覆"相连。

2016

一战成名

实验室的灯光彻夜未熄,最终凝结成《Nature》封面上那只改写自闭症研究史的实验猴。 这项全球首例非人灵长类自闭症模型研究,不仅让烈冰戴上"国家级高新技术企业"的桂冠, 更在学术界投下一枚深水炸弹:中国团队,正在定义生物科技的边界。

2018

剑指单细胞

当同行还在观望单细胞技术的商业化前景时,烈冰已与腾讯、华大携手,率先引入进口平 台搭建全流程服务体系。这场豪赌背后,是团队对技术风向的敏锐嗅觉——他们知道,生 命科学即将迈入"单细胞分辨率"的新纪元。

2020-2021

逆势突围

疫情阴霾下,烈冰完成pre-A轮融资,江西智造基地拔地而起。 自主研发的PanoCell单细胞平台与数据浏览器接连问世,30余篇顶刊文章如同烽火,照亮中国单细胞赛道的天空。 当营收首破亿元大关时,他们已在筹备更震撼的武器——空间转录组技术。

2022-2023

定义规则

蝉联市场前三甲的成绩单上,70篇、110篇、170篇...单细胞成果数量连续攀升。 南京、西南、武汉办事处星火燎原,CytoNavigator云平台迭代升级。 与圣湘生物实验室的共建,标志着烈冰开始输出行业标准。

2024

重构生态

当NovelCyto单细胞微孔平台、组织解离仪、自动化工作站轰鸣启动,烈冰终于亮出蛰伏十年的底牌: 用"智造"打破进口依赖,让单细胞技术从"奢侈品"变为"日用品"。 此刻回望,那条从软件算法到硬件自主的进阶之路,正是中国科研工具国产化的缩影。

烈冰力量

在烈冰之家,提起我们自主研发的工作站,大家脸上总会浮起一丝自豪。它们的诞生,本身就是“烈冰力量”最生动的注脚。

故事,从痛点开始:

几年前,实验室里常弥漫着一种"甜蜜的烦恼"。随着项目激增,样本量像雪球一样越滚越大。传统的cDNA反转录和RPE扩增,步骤繁琐、耗时长、高度依赖人工操作,还容易出错。研究员们宝贵的精力,大量消耗在重复性极高的移液、计时、温度转换上。效率成了瓶颈,产能卡了脖子,大家心里都憋着一股劲:必须改变!

"烈冰力量"的具现化:攻坚克难

于是,一支由软硬件工程师、生物学家组成的"攻坚小队"成立了。目标很明确:造出属于烈冰自己的、更聪明、更可靠、更能"扛活"的自动化工作站。

"翻译官"的诞生(cDNA反转录工作站): 要让脆弱的RNA精准、高效地"翻译"成稳定的cDNA,难点在于如何实现复杂液体处理的精准控制、温度梯度的毫秒级切换,以及防止样品交叉污染。团队泡在实验室,图纸画了又改,代码写了又调,电路板测了又焊。为了一个移液精度问题,工程师带着黑眼圈,连续调试了72小时;为了优化热循环模块,生物学家老王反复对比了上百组数据,只为找到那个"刚刚好"的反应条件。多少个深夜,实验室的灯光与电脑屏幕的微光交织,键盘声和讨论声成了背景音。最终,这台能自动完成RNA定量、体系配制、精准温控反转录、产物纯化的"翻译官"诞生了。它不再是冷冰冰的机器,而是凝聚了团队无数个日夜心血的"智能伙伴"。

"复印员"的进化(RPE扩增自动化工作站): 如何将珍贵的cDNA样本,高保真、高通量、无人值守地扩增出足够数量用于后续研究?这是"复印员"的使命。团队借鉴了工业自动化理念,创新性地整合了精密温控、微流控技术、光学检测和智能算法。机械臂的每一个动作轨迹,都经过无数次模拟和实测优化;温度控制的均匀性和稳定性,达到了苛刻的分子生物学要求;内置的质控模块,能实时"盯"着扩增过程,确保"复印"不出错。工程师说:"我们要的不是简单的自动化,是智能化的、可信赖的生产力。"这台工作站最终实现了从样本分配到结果输出全流程无人化、标准化、可追溯,大大解放了人力,也彻底告别了手动操作的误差和批次间差异。

价值,在轰鸣中彰显:

这两台"土生土长"的工作站投入运行后,带来的变化是实实在在的:
效率飙升: 原本需要研究员大半天甚至一天才能手工完成的反转录或一批RPE扩增,现在交给"翻译官"和"复印员",几小时内就能高质量完成,且能7x24小时不间断运转。项目周期被显著压缩。

产能飞跃: 高通量处理能力是核心优势。单日处理样本量成倍甚至数倍增长,为大规模筛选、队列研究提供了坚实的硬件基础,公司承接大型项目的能力和信心倍增。

质量跃升: 标准化、自动化最大程度消除了人为误差。实验结果的一致性、可重复性达到了前所未有的高度,数据更可靠,研究结论更扎实。这为后续的药物靶点验证、生物标志物发现等关键环节奠定了高质量的数据基石。

解放"最强大脑": 研究员们终于从繁琐的重复劳动中解脱出来。他们的时间和智慧,得以投入到更具创造性的实验设计、数据分析和科学探索中。人才的价值,得到了更高效的释放。

成本优化: 虽然研发投入巨大,但长期来看,效率提升、错误率降低、人力成本优化,带来了显著的综合成本优势。

"烈冰力量"的传承与升华:

这两台工作站,不仅仅是冰冷的金属和电路。它们的每一个模块、每一行代码,都浸染着烈冰研发团队的汗水、智慧和那份"死磕到底"的韧劲。它们是"烈冰力量"—— 即面对挑战勇于创新、在核心环节追求自主可控、在平凡工作中追求极致效率与可靠性的精神——实体化勋章。

它们站在实验室的核心位置,安静却有力地运转着。它们发出的轻微嗡鸣,是效率提升的乐章;它们精准无误的动作,是质量保障的承诺;它们源源不断输出的高质量数据,是驱动烈冰药物研发引擎的核心燃料。

烈冰生物,以自主研发之"烈",破效率与产能之"冰"。 我们亲手锻造"翻译官"与"复印员",不仅是为了看清生命的密码,更是为了更快、更稳地将科学发现,转化为守护健康的切实力量。这份源于自主创新的"烈冰力量",将持续驱动我们,在解码生命、对抗疾病的征途上,走得更深、更远、更坚定。

烈冰智慧

烈冰科技创始人宗杰:"最强大脑"助力科学研究
一一我与NovelBrain®云计算系统

2017年9月

基因测序技术的发展是开启精准医疗时代的主要推动力,随之而来的测序数据也呈爆炸式增长,精准医疗的到来也开启了医疗健康大数据时代。然而,如何及时获取、高效分析、储存这些庞大的数据是当前急需解决的问题,实际应用中对大数据处理的运算速度、稳定性、可重复性的要求亦迅速提升。应运而生的生物云计算系统吸取互联网大数据经验,在人力成本极低的情况下即可轻松解决数据管理、存储、分析的问题。
测序中国采访了烈冰科技创始人宗杰博士。在专访中,宗杰博士详细介绍了烈冰科技的云计算平台——NovelBrain®,并分享了他与生物云计算系统的不解情缘。

源于科研,服务科研

作为公司创始人,当初是什么让您选择了生物信息领域,并深耕于此创立了烈冰科技?

宗杰博士:自2009年起,高通量测序技术便逐渐在全国范围内推广并普及,当时正值我在上海交通大学攻读生物学博士学位,导师为生命科学技术学院的张大兵教授。我们课题组当时也开展了一些测序工作。张大兵教授知道我的计算机底子比较强,也对这方面十分感兴趣,便试着让我进行一些测序数据的整理和分析工作。就在这样的契机下,我开始接触到了生物信息学分析这一领域并逐渐深入。

在那个时候,测序公司给客户的结果都太过流程化,而客户的定制化分析需求很多,与技术相匹配的可用软件却是少之又少,使得数据分析结果总是不尽如人意,而这些定制化的需求有着重要意义。于是在2010年,我和创业伙伴一起成立了上海烈冰信息科技有限公司,从事生物信息数据分析工作,希望能够从冰冷的数据中挖掘出具有活力并且有价值的信息。在公司成立不到一年的时间里,我们就帮助客户发表了10余篇文章,影响因子累计达到50多分。

在2012年的时候,ABI发布了基于半导体的单端测序平台,我们在国内第一个引进了半导体测序平台。烈冰科技也顺利完成了从测序服务公司到集生命科学研究与应用研发于一体的科研服务型公司的全面转型,并在2013年协助发表了基于Ion Proton测序平台的第一篇转录组文章以及第一篇Nature文章。

之后,我们又陆续引入了更多的测序平台,在专注生物基础研究的同时,更率先搭建了云端分布式计算及存储系统,并构建了基于自主算法的大数据分析平台及数据库,成功开发了基因大数据分析管理云系统——NovelBrain®

对于创业的初衷,首先这是我个人兴趣所在,软件研发对于我来说是个"新大陆",一个小程序可以省去大量重复性的劳动,大大提高工作效率,当自己设计的程序运行起来时,所获得的成就感是无与伦比的。其次,市场上对数据分析服务的需求是很庞大的,而且随着高通量测序的普及,有越来越多的数据等待挖掘生物学的意义,这就需要懂生物又懂计算机的人跳出固有的学术圈子,为广大科研工作者提供个性化的定制服务。这是我创业的初衷,也是我们团队一直在坚持的事情。

打造"三位一体"的全产业链

目前烈冰科技的业务主要集中于哪些方面?有哪些核心竞争力?

宗杰博士:在我们公司创立初期,数据分析都是以黑框代码的模式实现的,那时候生物信息工程师非常稀缺,于是我们开发了第一版基于单机的分析系统,使得懂生物的人可以不写代码进行数据分析。当时的目的很简单,就是为了让公司的少数几个生物信息工程师可以把精力放在生物学意义的挖掘上,提高工作效率及公司的服务品质。

在2012年的时候,随着互联网大数据的热潮,越来越多的大数据解决方案也在互联网公司落地,我们认为可以用这种大数据技术帮助解决生物学问题。实际上在2013年上半年,最初版本的云计算系统就已经在公司内部使用了。毫不夸张地说,我们的云计算平台是经过了长期生产环境考验的系统。这一系统经过反复迭代,并逐步扩展功能,最终形成了现在的NovelBrain®云计算平台。

我们希望这套云计算系统在提高生物信息分析效率的基础上,能够帮助科学家发现生命数据中的价值,加速生命科学的研究,同时也希望能为精准医疗提供坚实的技术基石。

具体而言,NovelBrain®云计算平台能帮助到哪些用户?

宗杰博士:目前来说,云计算的用户主要为科研工作者、大型科研机构、相关企业以及测序工厂等。其实,NovelBrain®云计算平台不仅可以用于科研工作,进行数据分析,还可帮助企业智能化管理。

对于科研工作者,NovelBrain®云计算平台采用可视化、便捷化的操作,大幅度提升了数据分析的效率,对于不同的物种、群体及数据轻松实现定制化的数据分析;对于医院,平台结合新型的交付模式,整合多个数据库,最终实现一站式的结果报告和解决方案;对于企业管理者,系统打通了erp和数据分析之间的屏障,企业级管理工具支持全球异地办公、多人协作,最大程度调动资源,提高员工工作效率,助力企业快速发展。

在未来,我们希望每一个普通人都能独立使用NovelBrain®系统来解析自己的基因组数据,真正读懂自己的基因。当然这个还需要很长时间的努力,可谓"路漫漫其修远兮,吾将上下而求索"。

弯道超车,后继发力

相比Seven Bridges等多个国内外其他公司的生物云计算平台,NovelBrain®有着怎样的独到之处?在技术上我国能否实现赶超国外?

宗杰博士:其实,国内与国外的云计算相比,拥有弯道超车的后发优势。

实际上,从2013年开始,国内外的公司包括阿里云、百度云等都提供了新的计算模式,比如批量计算等。通过新型计算模式,生物云计算的开发和运营变得简单、快速。在此基础上,国内的底层框架与国外相差不大,所以国内外的公司相当于站到了同一个起跑线上,拥有类似弯道超车的后发优势。

而对于NovelBrain®,首先是零代码,完全不懂编程和生物信息的用户都可以轻松上手。其次,烈冰科技积累了多年的数据分析经验和科研优势,NovelBrain®平台可以说是针对生物学意义的挖掘进行了大量优化,所以相比其他的生物云计算平台,我们有更多的生物学意义相关挖掘工具,譬如基因的功能分析、趋势分析、基因调控网络构建、疾病关联等。

此外,NovelBrain实现了目前行业内的几个特色。

国际唯一实现高度定制化分析:我们为NovelBrain®云计算平台设计了高度定制化功能,不仅能新建或修改工作流,而且用户能在分析运行前、运行中、运行后随时修改和运行分析流程。同时平台还提供开放式API接口,支持上线用户自行开发的算法,分析工具可拓展,满足研发需求,真正实现最高程度定制化。

国内首个实现Hadoop-Docker生物信息框架:烈冰科技为了实现NovelBrain®云计算平台的高容错、高可扩展和高可用,选取了Hadoop生态系统中的hdfs、zookeeper、MapReduce和YARN组件,并进行了一系列不同程度的优化,自主搭建了云平台的分布式底层框架。同时采用轻量虚拟化技术Docker,并修改了Hadoop-YARN的底层代码,优化了其对Docker的支持。一方面实现了计算隔离,保证了系统的安全性;另一方面通过虚拟化机制实现分析软件和算法的一致性,保证了数据分析可重现。

国际唯一实现容器级CPU&内存实时监控:我们通过对接Docker和Hadoop-YARN的API,将分析中的任务可视化展现,不仅能直观看到本次分析过程中使用了几个容器进行并行计算,还能监控每个容器每个时间点所使用的CPU&内存信息。

此外,在数据库方面,我们一方面对NCBI、AMIGO、KEGG等经典数据库进行整合,还针对临床整合了CIViC、PharmGKB等数据库,使得基因解读更具临床可操作性。为了构建更大的数据库,我们还同时整合了TCGA等数据库信息,可对大样本数据进行基因信息深度挖掘。

另外,我们还有实验室管理、企业管理等附加功能,我们结合了实验室lims系统和销售订单管理系统,那么一个样本从下单、接收、保存、抽提质检、建库、上机到数据分析以及最后的分析结果和关联医药数据库的一整套流程,在我们系统中都可以从头到尾的监控起来,真正做到完备的质量控制和可回溯。同时我们也初步搭建了一个基于数据分析meta信息的搜索引擎,可以快速地查找录入的数据,并结合公开数据库进行深度挖掘。

深耕科研,关爱生命

未来,您对烈冰科技有着怎样的发展布局?

宗杰博士:公司会继续保持科研、云计算和转化医学三者统一的关系。目前,烈冰在科研领域已经拥有了一大批忠实用户,科研即是公司立足的资本,通过科研不仅可以为后续的云计算提供资金支持和技术支持,还能保证公司的研发方向始终紧跟国际前沿。

其次是云计算和转化医学。NovelBrain®公有云系统实际于2017年初即完成开发工作,目前NovelBrain®基于这套系统还整合了药物基因组学和疾病相关的数据库。基于云计算和科研开发的一些基因产品也在陆续面世中,未来希望把重点放到转化医学上去。

科研、云计算和转化医学,一方面是相辅相成的公司业务链,另一方面也是全产业的发展布局,转化医学和云计算都是我们的重要产业布局。未来我希望能够将NovelBrain®推广到普通人群中,让普通人也能解码自己的生命,并且通过解码生命的途径促进更多人去关注和关爱自己和家人朋友的生命。

回望2017年,当宗杰博士提出以科研为基石、以云计算为引擎、以转化医学为目标的战略布局时,这一思路无疑走在了生物信息工业化生产的前沿,我们正尝试推动生物信息分析走向更系统、更高效的路径。然而,我们对生物信息学与分析平台的理解从未止步——随着数千个项目、上万个样本的积累与实践沉淀,最终凝聚为CytoNavigator的逐步成型。

2023年,烈冰正式推出CytoNavigator单细胞数据分析与可视化平台,它像一名静默而可靠的“科研罗盘”,旨在将复杂的生信流程转化为可重复、可扩展的标准化工作流。
2024年,平台拓展至转录组全域,支持单细胞与常规转录组数据的“零代码全链条分析”,让研究者摆脱代码依赖,专注科学问题本身。
2025年,CytoNavigator空转云平台全面上线,覆盖高分辨率空转各类分析,并持续引入前沿期刊认可的工具方法,推动多组学整合进入一键投递的时代。

从细胞聚类到稀有亚群发掘,从时空轨迹到细胞互作,CytoNavigator不仅是烈冰技术能力的集中体现,更是生信专家、工程师与研发团队多年协作的成果——它是一张逐步织就的“分析之网”,致力于让生物信息解读变得更流畅、更直观、更可及。

我们始终相信:真正的平台,不只是工具,更是洞察;不只是分析,更是理解。烈冰,持续走在理解生命的路上。

烈冰速度

烈冰的成长故事:一场与时间的竞速

烈冰的故事,始于对生命密码的好奇心,成长于一次次对"不可能"边界的挑战。 从最初扎根测序与分析,到敏锐捕捉单细胞技术的浪潮,我们并非随波逐流,而是选择以自研为桨,以速度为帆,奋力航行。

早期,我们用NovelBrain云平台叩开了生物信息互联网化的大门,让分析不再受限于本地。当全球首例猴自闭症研究成果闪耀《Nature》时,这份国际认可印证了我们扎实的科研功底。但这只是起点。面对单细胞这片新兴的蓝海,烈冰果断战略转型,不仅快速搭建顶尖平台提供一站式服务,更深知核心工具必须掌握在自己手中。

于是,一场静默的"速度革命"在内部展开:PanoCell单细胞平台、CytoNavigator智能云分析系统、NovelCyto微孔平台、自动化工作站、组织解离仪… 一件件凝聚着烈冰智慧的自研利器接连诞生,从软件到硬件,不断突破效率与认知的极限。江西生产中心的建立、全国多地办事处的落子、与行业巨头的深度合作,每一步都踩在发展的鼓点上。营收破亿、180+篇高质量成果的积淀,是这场疾驰之旅最坚实的里程碑。

烈冰速度,是刻在骨子里的成长基因: 它是对前沿技术趋势的敏锐洞察与快速响应,是对核心能力坚定不移的自主研发投入,更是将创新成果转化为用户价值与市场认可的高效执行力。 这不是简单的加速,而是一种在生物医药创新赛道上,将雄心转化为现实的系统能力与坚定信念。

烈冰速度,是刻在基因里的成长节拍:

它体现在技术迭代的迅捷:从跟随到引领,自研平台不断突破边界。
它彰显于成果积累的厚度:从零到百篇高质量产出,步履不停。
它烙印在版图扩张的足迹:从一隅到全国布局,服务网络日益完善。
它凝聚于核心智造的突破:从软件到硬科技,全链条自主能力日益坚实。

这不是简单的快,而是:

对科学前沿的敏锐洞察与快速响应。
对技术自主的坚定信念与持续投入。
对用户需求的深刻理解与高效满足。
对产业发展的躬身入局与积极塑造。

"烈冰速度",不是冷冰冰的指标,而是融入血液的行动本能。它是技术实力、高效协同、极致责任心以及对客户目标深度认同的化学反应。我们不断锤炼这套从"听见呐喊"到"解决问题"再到"持续护航"的完整高速响应体系,只为让合作伙伴的科学探索,因为烈冰的存在,跑得更快,看得更清,走得更远!