继上次公布NovelCyto实验现场过程后(戳这里了解获取详情),大家对下机测序数据分析的结果非常关注!!!NovelCyto的实力到底如何?今天烈小冰就用实测数据,带您进行全方位了解!
实 验 流 程
样本信息:小鼠胚胎组织(数据量>100G/样本)
实验设计:Batch1、Batch2 (两次生物学重复,均使用烈冰自研NovelCyto单细胞捕获方案)
注:以下实测数据结果均来源于同一样本(小鼠胚胎组织)解离后的细胞悬液,在相同实验条件下(时间,仪器,试剂,初始上机细胞数等)完成。
实 战 数 据 测 评
01 测序数据均达国际一线水平
实际数据情况:
捕获细胞数量:两次测试分别捕获10,783个细胞和9,461个细胞;
Mean Reads per Cell:约40K,符合单细胞数据分析标准;
Fraction Reads in Cells:达到了理想值80%以上;
Valid Barcodes:均在90%左右;
基因中位值、中位数UMI、基因总值等关键参数的数据分析指标上均表现出色,且重复性很高,也说明测试数据的稳定性。
02 细胞分群清晰、重复性极佳
基于细胞聚类分析的结果,可实现多种细胞的无偏捕获;且不同样本间几乎不存在批次效应,即具备捕获细胞稳定性和数据高度重现性。
测 评 总 结
以上便是此次烈小冰为大家带来的数据分析实战测评结果。总的来说,NovelCyto微孔法重力沉降单细胞捕获方案在捕获细胞数,中位基因数,UMI Counts数,mapping率及批次重复性等关键指标上,均呈现高质量的结果,具备优良的实验服务水准,准确反映出细胞的转录状态,且具备强有力的价格优势!烈冰出品,必属精品,一站式精准服务,要做就做最懂你的单细胞平台!
下期,小编将继续介绍NovelCyto实测样本在细胞分群注释等方面的优秀表现~
更多详情可关注烈冰官方公众号或联系驻地销售,获取更多平台信息!