单细胞多组学分析实验案例解析

2024-12-26

单细胞多组学分析实验案例解析

通过单细胞多组学分析深入鉴定耗竭T细胞

T细胞耗竭：慢性病毒感染或癌症T细胞持续受到刺激，从而导致T细胞功能障碍。

T细胞耗竭的特征：T细胞耗竭的特点是功能逐渐丧失，抑制性受体持续表达。

T细胞耗竭是可逆的：

免疫检查点阻断疗法：耗竭T细胞上可以同时表达不同的抑制受体。

研究T细胞耗竭的重要性：

1. 了解浸润T细胞的多样性和复杂性

2. 发现调节T细胞耗竭和促进癌症进展的新机制

3. 优化CAR T细胞生成方案

4. 筛选能够预防或逆转T细胞耗竭的新分子

单细胞多组学分析研究的优势：

BD Ab-Seq与BD Rhapody™系统结合，可在单细胞水平上同时进行蛋白质组与转录组分析，并能根据免疫表型和基因表达谱的相关性深入分析细胞特征、了解细胞过程的机制、识别新群体的分化模式。

Ab-Seq技术与流式细胞术的相关性研究：

Ab-Seq技术与流式细胞术数据的一致性：

T细胞聚类：

差异蛋白表达分析：

差异基因表达分析：

在单细胞水平上关联蛋白和基因表达：

同时分析蛋白和基因表达的优势：

1. 选定目标基因和蛋白表达的相关性，以了解激活后的调控机制（转录或转录后调控）。

2. 卓越的细胞鉴定及分群能力。

3. 根据免疫表型和基因表达谱组合进一步解析T细胞亚群。

通过单细胞多组学分析肥胖小鼠免疫细胞

通过分析高脂饮食 (HFD) 小鼠的免疫细胞组成和基因表达谱来描述肥胖引起的慢性炎症。

BD Ab-Seq与BD Rhapsody免疫反应面板的结合提高了细胞聚类分辨率：

t-SNE图降维：

BD Ab-Seq检测确定了每个组织中的主要细胞群：

热图显示了各组织中表达量最高的蛋白质

准确识别目标细胞群：

单细胞蛋白质与mRNA的相关性：

无偏细胞聚类可识别不同样本中的多种细胞表型：

无偏聚类揭示与疾病相关的疾病表型：

亚群显示HFD小鼠脂肪组织的细胞数量存在差异：

对照组和HFD小鼠脂肪组织的t-SNE图：

HFD会导致脂肪组织中的免疫细胞组成发生剧烈变化：

HFD增加脂肪组织中B细胞的频率：

工作模型：