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开启空间探索的新篇章-实现微米级分辨率的空间转录组分析

时间:2024-02-07    |    阅读量:328

10x Genomics 最新推出的空间转录组新产品 Visium HD 芯片,将现有 Visium 平台的分辨率从 55 um spot 提高到无间隙的 2um方格,从而实现单细胞水平的空间组织结构分析(无间隙的组织覆盖)!


Visium HD 微阵列由连续的寡核苷酸组成,排列在 ~1100 万个无间隙的2 x 2 µm条形码标记的正方形中,8 x 8 µm大小的分析单位是10X官方推荐的可视化和分析的起始点。


一、 Visium HD特点:

1 以单细胞分辨率(2*2µm)对组织进行生物学分析,连续的组织覆盖率,探索整张组织切片中以往被隐藏的生物学信息


2 高质量的空间数据-CytAssist平台能够实现精准的转录本定位



3 兼容人和小鼠的各种FFPE样本


4 兼容H&E染色和IF免疫荧光染色


二、 Visium HD 工作流程


(Visium HD基因表达探针的文库结构)


三、 高质量数据呈现


利用 Visium HD建立人乳腺原位导管癌的空间全转录组精细图谱,以单细胞分辨率识别肿瘤微环境中的主要细胞类型和状态;利用 Visium HD能够准确绘制在小的生物结构中细胞类型的空间组织,如MYH11 的表达特征明确了血管的空间结构;可以定位组织驻留的细胞群,包括免疫细胞或癌细胞,揭示它们的相互作用和对疾病或治疗反应的贡献


四、 技术对比:



Visium HD能够以单细胞分辨率和高质量数据揭示FFPE组织样本中微米级的独特生物学特性,结合烈冰生物CytoNavigator百万级大通量单细胞数据分析系统,助力客户更快开拓空间基因表达的新发现!

烈冰生物已开启新品预售活动,想抢先体验的老师欢迎联系对应驻地销售或者客服021-52235399!