2023年7月17日，10XGenomics最新高精度原位空间组学平台Xenium落户上海烈冰生物，烈小冰带您先睹为快！先来感受一下10X最新技术的风采!探秘Xenium内部精细严谨的结构一、Xenium平台简介Xenium是以亚细胞分辨率对基因和蛋白质进行靶向空间组学研究的平台，相较Visium空间转录组拥有更高的检测精度。不仅如此，可视化Xenium数据可以让烈小冰能看到每一个细胞中的数百个RNA探针靶点表达情况，这些细胞构成的微组织结构也是一目了然，简直打开了研究的新世界。二、Xenium原位分析仪技术原理Xenium的技术原理，其核心是基于Padlock探针的多轮荧光检测技术，它让脱胎于FISH技术的Xenium同时可检测基
肿瘤相关巨噬细胞（TAM）如何诱导TAM重编程成M1促炎型，同时阻止M2抗炎型极化是提高抗肿瘤效果的关键所在。
前列腺癌（PCa）是男性中最常见的恶性肿瘤，它的发生和发展与雄激素受体（AR）信号密切相关。雄激素剥夺疗法（ADT）一直是局部晚期和转移性肿瘤患者的主要治疗方法。然而，尽管使用第二代抗雄激素药物治疗，如苯扎鲁胺（ENZ）和阿比特龙，最初会限制肿瘤，大多数患者最终复发为转移性去势抵抗PCa（mCRPC）。越来越多的证据表明，肿瘤微环境（TME）与去势抵抗性前列腺癌（CRPC）有关，肿瘤相关成纤维细胞（CAFs）是肿瘤基质中最丰富的细胞类型之一，呈现异质性与表型可塑性，在体外，iCAF（炎症成纤维细胞）、myCAF（肌成纤维细胞）和apCAF（抗原呈递类成纤维细胞）会根据培养条件进行相互转化。然而，目前还不清楚CAFs命运转换和表型转换
根据世界卫生组织（WHO）的数据，自2017年以来，重度抑郁症（MDD）已成为世界上最主要的残疾原因之一，其潜在的细胞和分子机制已有研究者对于男性的MDD基于单细胞分辨率进行初步探索（CorinaNagy,NatNeurosci2020）。本研究为首次基于单细胞核测序技术（snRNA-Seq）以及空间组学技术（SpatialTranscriptome），采用灵长类造模，对于女性受社会地位MDD的致病机制进行了研究，并定位致病关联的细胞类型。烈冰科技合作伙伴——重庆医科大学附属第一医院神经内科团队针对上述问题开展了系列研究，于2023年7月在NatureNeuroscience（IF=28.771）上发表了题为“Integrating
4月9日，为期3天的中国肿瘤标志物学术大会暨CACA整合肿瘤学峰会暨第十六届肿瘤标志物青年科学家论坛暨中国肿瘤标志物产业创新大会以四会联办的形式，在海纳百川的上海圆满落下帷幕。本次盛会秉承“创新、转化、合作、共享”理念，全方位、多视角、多学科交叉融合，由陈义汉院士、贺福初院士、王红阳院士、宋尔卫院士、林东昕院士等14位院士共同领衔，570位肿瘤标志物领域医研企专家共聚一堂，4场开幕式/主旨报告、38个主题论坛、2场培训班、1场全委会及25场卫星会共计70场活动，参会代表超过6000人。百位领域大咖多视角分享团队最新成果解读最新热点，现场气氛热烈、座无虚席！烈冰生物作为单细胞领域的标杆企业，受邀并以多种形式高规格参与本次盛会。01.联
沿袭冰冻组织空间转录组实验，VisiumFFPE测序也需要对组织进行切片，因此客户提供样本时，可以是前期保存的石蜡组织块，或取新鲜组织用石蜡包埋。后续切片、质控、RNA信息捕获及文库构建和生信数据分析等工作，全部由烈冰完成，具体实验流程如下：FFPE样本切片厚度一般为5μm（区别于冰冻组织样本的10μm），切片样本大小不宜超过6.5mm×6.5mm（载玻片的大小），超出的部分无法被捕获到，反而可能会影响其他样本空间信息。组织样本太大怎么办？可以根据不同病变区域分为多个样本。例如，肿瘤组织可以分为中心/边缘/正常组织进行切片观察。另外，对每个FFPE样本，都需要做FFPE贴片粘附性实验。通过切片脱蜡染色再复水，显微成像观察脱片情况，保
2020年夏天，烈冰正式上线了空间转录（Visium）组测序服务，一年的时间里，我们后台陆续收到了一些关于空间转录组技术的留言，比如之前保存的FFPE组织，能不能拿来做空间转录组测序？听说国内空间转录组现在可以做FFPE样本了，是真的吗？各位看官别急，今天咱就来唠唠，看着风很大的VisiumFFPE空间转录组到底是什么，和之前的Visium冰冻组织样本（以下称visium）区别在哪？FFPE即石蜡包埋，是目前绝大多数科研人员和临床医生首选的长期保存样本的方法，该方法可将珍贵样本保存几年甚至10年以上，且大多样本通常有对应的临床匹配追踪数据，若能结合高通量测序数据，对疾病研究和治疗来说都有非常大的意义。但因FFPE样本通常保存时间长，
近日，《基因组蛋白质组与生物信息学报》（Genomics,Proteomics&Bioinformatics,简称GPB）公布了2022年度“中国生物信息学十大进展”，针对肝脏肿瘤免疫微环境中的中性粒细胞的大队列研究成果《Livertumorimmunemicroenvironmentsubtypesandneutrophilheterogeneity》上榜。值得注意的是，该研究采用124例肝癌患者病例的160个样本，8只小鼠的29个新鲜组织样本，基于Drop-seq技术（10xGenomics平台)进行了大队列中性粒细胞在肝癌的免疫微环境亚型的异质性研究。01.实验设计团队采用肝癌患者160个样本(124个病例），29个新
近日，烈冰合作伙伴上海质子重离子医院孔琳教授团队在NatureCommunications（IF=17.694）上发表了题为“Tumor-intrinsicYTHDF1drivesimmuneevasionandresistancetoimmunecheckpointinhibitorsviapromotingMHC-Idegradation”的论著。该研究通过单细胞测序技术（scRNA-seq）揭示了肿瘤固有的YTHDF1驱动免疫逃逸和免疫检查点抑制剂（ICI）抵抗，YTHDF1缺失促使免疫系统恢复监测。承担了本研究中的单细胞测序，下面跟随小编的步伐，一起来看看本文的实验设计和研究成果吧~实验设计单细胞实验分组：Ythdf1-KO
