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PanoCell2.0方案：高质量、高效率、高性价比
烈冰生物11999元畅享PanoCell单细胞测序活动火热进行中（戳这里了解获取详情），
烈小冰的服务热线快被打爆啦:
11999元的单细胞测序是真的吗?
我想做新版PanoCell单细胞测序，可否联系北京销售找我对接？
你们PanoCell平台看着蛮好的，数据分析结果啥时候公布来？
PanoCell靠谱吗？有没有进一步的数据支持？
......
本着对客户负责任的态度，在上线前我们已经对新版PanoCell服务平台进行N多次稳定性测试，为了让大家更直观感受2.0版PanoCell微孔芯片的实力，小编熬夜爆肝多日整理了2.0版PanoCell芯片与BD多版本原装试剂组合的数据分析结果，这就带大家一探究竟~
————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————采用同批次2个独立的PanoCell 2.0 微孔芯片对来自同一PBMC标准品的样本进行实验，实验试剂采用2个独立的BD原装试剂盒，在同一天内随机分选约10000个PBMC细胞上机、构建文库并按等效深度进行测序（数据量约100G/样本）。
在PanoCell 2.0平台上，我们实现了对多版本的BD原装试剂的适配性检测，Cells load、Beads load、Beads wash和Retrieval的4个实验环节实测数据均表现出优异性能。
图1. Scanner扫描实验捕获细胞过程。（图A、B、C、D依次为Cells load、Beads load、Beads wash和Retrieval的4个实验环节扫描实拍图
从Beads wash后的Scanner扫描局部细节图来看，几乎每个微孔中都落入一个Bead，细胞落孔分布均匀，有效的实现1个细胞与1个Bead 的结合，多版本BD原装试剂与PanoCell2.0 芯片均能实现完美兼容。
图2. Beads wash后扫描落孔局部细节图。(左图：PanoCell-V1；右图：PanoCell-V2）
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相同实验方法下，PanoCell 2.0 微孔芯片在多版本的BD原装试剂组合使用过程中均获得了稳定的高质量数据，细胞数量评估曲线较为一致，每个样本细胞捕获数量在8000个左右，PanoCell 2.0芯片表现出优异的细胞捕获能力，所得结果具有较高的置信度。
图3.Estimated Number of Cells曲线。(左图:PanoCell-V1；右图：PanoCell-V2）
PanoCell-V2的中位数基因和中位数UMI数据较V1样本分别提升了21.6%和23.1%，这也与新版试剂产品性能提升的结果一致，PanoCell 2.0芯片能够较真实反映样本信息的捕获情况，不会引起额外的实验偏差。
图4.中位数基因与中位数UMI参数对比
对比相同细胞上样数（10000个细胞）的数据，为与BD官方数据具有可比性，我们对100G测序数据的样本进行了downsample的等效深度处理（8k per cell）：参数Median Gene per cell和Median UMI per cell也基本和官方公布参数相对应。
图5.等效深度下测序参数对比，BD样本数据引自官方公布结果
PanoCell2.0微孔芯片在样本捕获基因数( 分别有效检测到PBMC样本中的基因数为23071和24898，60Kreads per cell）和捕获reads mapping率等其他数据参数上也表现出色，各项指标均达到国际一线水平。
图6.检测基因数等其他测序参数对比
基于聚类分析和细胞类型鉴定，PanoCell 2.0微孔芯片可实现包括monocyte、DC在内的多种细胞的无偏捕获；细胞样本来源Umap结果显示，不同样本的不同重复运行之间不存在批次效应，应用PanoCell 2.0微孔芯片的单细胞测序实验方案具备优秀的捕获细胞稳定性和数据高度重现性。
图7.聚类分析与细胞类型鉴定。（左图：聚类分析与细胞类型鉴定Umap图；右图：样本来源Umap图）
我们此次发布的PanoCell2.0升级版单细胞测序服务方案，在整个实验及数据分析环节表现出色，
该方案大幅度降低了单细胞测序技术的使用成本和应用门槛，方便更多科研和临床学者开展单细胞测序工作，推动单细胞技术在肿瘤、免疫、生殖、发育和神经甚至是植物研究等多领域的应用。
图8. 烈冰单细胞数据分析可视化系统--
PanoCell2.0升级版单细胞测序服务方案已于9月23日上线！详情可关注烈冰官方公众号或联系驻地销售，获取更多平台信息。
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