在单细胞测序领域,针对细胞捕获目前主流的是两大单细胞捕获原理--“重力沉降微孔法原理与动态微流控原理”,两种捕获方法各有千秋。此前烈冰已推出自研的微孔法单细胞捕获方案广受好评!如今烈冰经过多年的调试以及内测实验,新一代国产微流控单细胞解决方案--“Novel DropTM”终于破空而来,即将正式发售!
一、捕获原理
烈冰Novel DropTM微流控单细胞解决方案基于动态微流控原理进行单细胞的分离与捕获。具体来说,细胞悬液、CellBarcode Beads与氟化油分别有专属通道,CellBarcode Beads与细胞悬液在反应体系内进行特异性捕获,再经过含有氟化油的通道以隔离单个细胞,最终形成油包水产物。
二、产品优势
1、自动化完成单细胞捕获
“Novel Drop NavigatorTM”自动化单细胞分选仪采用精密的液压控制,配套自研的微流控芯片和柔性胶珠,精准控制样品流体流速和液滴生成,助力高效完成单细胞捕获。
2、操作简便,一键RUN机
“Novel Drop NavigatorTM”自动化单细胞分选仪独特的智能化的仪器操作界面,一次RUN机,可至8样本单细胞分选及文库构建,实验全流程均可一次性完成,避免人为操作实验偏差。
3、全自动8通道独立控制
芯片采用A、B盘位模式、8通道独立控制的设计,每个通道均可独立控制实验进程,互不干扰,且可根据样本数量进行自由选择,满足用户的个性化需求,使实验更具针对性。
4、兼容分析平台、分析无忧
烈冰Novel DropTM微流控单细胞解决方案的测序数据可完美兼容烈冰自研单细胞数据分析系统--CytoNavigator,0代码一键分析,轻松解决单细胞数据分析繁琐的痛点,还有高可交互的可视化系统、以及自组织的结果简报,可以大幅度加速解读实验结果,助力用户挖掘更多科学发现!
三、实战测评
数据见证实力,我们来看看烈冰Novel DropTM微流控单细胞解决方案交出的“成绩单”。
1、样本获取
实验室从同一只小鼠中取材肠组织、肺组织、脑组织、血液样本分别处理
2、组织消化
将肠组织、肺组织、脑组织分别剪碎后,采用温和高效的烈冰组织解离仪进行组织消化。
3、悬液质检
将获得的四种样本细胞悬液进行上机质检:
肠组织样本活性为94.97%,细胞总数160万;肺组织样本活性为92.90%,细胞总数300万。
脑组织样本活性为92.23%,细胞总数200万;血液样本活性为94.90%,细胞总数70万。
四类样本活性均为90%以上,背景干净,符合细胞上机捕获要求。烈冰组织解离仪再次体现了其优越的样本解离能力!
4、上机捕获
“Novel Drop NavigatorTM”自动化单细胞分选仪与一样是微流控原理的国外平台新旧两种试剂的三个样本上机,建库测序后,对比两种平台的测序数据聚类分析结果。
5、结果对比
接着我们来对比四种样本的聚类分析结果差异~
将这三张聚类结果进行重合对比,来观察拟合程度:
将三个图进行重合对比发现。烈冰Novel DropTM与国外的旧试剂与新试剂聚类分析结果具有极高的一致性。下一步进行细胞类型鉴定,对比细胞类群占比情况:
细胞鉴定发现,在肠组织中,上皮细胞(Epithelial)、免疫细胞(Immune)烈冰Novel DropTM的占比均较国外平台新试剂高,同时双细胞率(Doublet)也更低。
肺组织
同样的,在肺组织中,烈冰Novel DropTM与国外的旧试剂与新试剂聚类分析结果也具有极高的一致性:
下一步进行细胞类型鉴定,对比细胞类群占比情况:
细胞鉴定发现,在肺组织中,上皮细胞(Epithelial)、免疫细胞(Immune)这两个研究者主要关注的细胞类群中烈冰Novel DropTM的占比均较国外平台高,同时双细胞率(Doublet)也更低。
脑组织
接着我们来看一下脑组织中,烈冰Novel DropTM与国外的旧试剂与新试剂聚类分析对比结果:
同样也具有极高的一致性,进行细胞类型鉴定,对比类型差异:
细胞鉴定发现,在脑组织中,胶质细胞(Gail)的占比烈冰Novel DropTM均较国外平台高,特别是星型胶质细胞(Astrocyte)显著较高,达到了22.08%,在双细胞率(Doublet)方面,烈冰Novel DropTM比与国外平台新试剂相当,捕获的总细胞增加了40%,与国外平台旧试剂相比,烈冰Novel DropTM的双细胞率显著更低。
血液样本
最后我们来看看血液样本的结果对比:
三个血液样本的聚类分析结果依然有高度的一致性,同样进行细胞类型鉴定比较细胞类群差异。
细胞鉴定结果可以看出,国外平台的双细胞率与烈冰Novel DropTM相比,已经达到了近2倍的差异,T细胞,B细胞两种细胞类型占比有所提升。
实验比较四种常见样本--肠组织、肺组织、脑组织和血液样本发现,烈冰NovelDropTM的聚类分析结果与国外微流控平台具有高度的一致性,同时双细胞率有所改善,使得细胞类型更全面。
烈冰NovelDropTM微流控单细胞解决方案凭借自研微流控仪器与试剂的强强联合,同时经过严格的实验体系验证,不仅实现了与主流进口平台的高度一致性,更在关键指标上展现出了显著优势,即将上市销售!