肾细胞癌（RCC）是世界上最常见的十大恶性肿瘤之一，主要表现为透明细胞性肾细胞癌（ccRCC）。ccRCC是最常见的肾细胞癌病理亚型，约占肾细胞癌的60%～85%，侵袭性强，转移率和死亡率高。代谢失调是ccRCC的一个关键特征，迄今为止，大多数临床代谢组学研究只关注代谢组学分析，单细胞和空间组学技术的发展有助于以更高的分辨率探索ccRCC中的肿瘤微环境（TME）图谱。

      本期，小编就来介绍一下烈冰生物合作伙伴华中科技大学同济医学院附属同济医院谌科教授、陶振教授、管维教授和海军军医大学附属长征医院任善成教授发表在《Nature Genetics》的文章，题目为“Multi-omic profiling of clear cell renal cell carcinoma identifies metabolic reprogramming associated with disease progression”。这篇文章对同济医院100例ccRCC患者（TJ-RCC）队列使用多组学联合分析，发现了一个独特的亚型：DCCD-ccRCC。并通过单细胞和空间轨迹分析，证明了DCCD是ccRCC进展的一种常见模式，揭示了ccRCC的进展机制。烈冰生物提供了单细胞核测序实验的相关服务。

发表日期：2024年2月

发表期刊：Nature Genetics

影响因子：IF=30.8

实验设计

• 单细胞捕获平台：10X Genomics

• 主要技术手段：

1. 全外显子测序（WES）、全转录组测序（WTS）、蛋白质组学、非靶向代谢组学：100份未经治疗的ccRCC样本、50份配对的正常邻近组织（NATs）样本

2. 单细胞核测序（SnRNA-seq）：不同亚型的ccRCC样本（n=10）

3. 单细胞ATAC-seq（SnATAC-seq）：不同亚型的ccRCC样本（n=10）

4. 空间转录组测序：不同亚型的肿瘤切片（n=12）和配对的NAT对照组（n=2）

主要研究结果解析

01 多组学描述同济医院RCC（TJ-RCC）队列的分子特征